En el periodo 2022-2026, la Subsecretaría de Educación Superior ha asumido el desafío de impulsar una agenda de modernización para la educación superior, consistente en un conjunto de procesos de reformas adaptativas que, mediante la adecuación y creación de instrumentos de política, regulaciones e incentivos, propendan a la articulación de un sistema de educación superior coherente y ordenado bajo los principios de cooperación y colaboración entre las instituciones y las agencias reguladoras.​

> Documento marco “Agenda de modernización de la educación superior chilena para un desarrollo humano y productivo sostenible” (noviembre de 2024).

Esta Agenda se organiza en torno a tres ejes estratégicos:​

• Modernización académica: configurar ambientes habilitadores para el desarrollo de trayectorias formativas flexibles. articuladas, y pertinentes con las prioridades y estrategias de desarrollo nacional, regionales y territoriales.​
• Modernización de la gestión, gobernanza y financiamiento de la educación superior: promover la coordinación estratégica de los distintos niveles de gobernanza del sistema y la actualización de instrumentos de financiamiento con orientación de política pública.​
• Educación superior para un desarrollo humano inclusivo, igualitario y sostenible: robustecer la vinculación de las instituciones de educación superior, cuidando su autonomía y a través de sus funciones, con las prioridades del país y sus territorios para un desarrollo humano inclusivo, igualitario, sostenible y orientado al bienestar.